（一）化肥生产企业成本持高不下。无烟煤是化肥生产的主要原材料，但占化肥生产成本70%的原材料无烟煤价格却居高不下。河南只有焦作有少量无烟煤，不能满足河南市场需求，一部分无烟煤是从山西省购进。最近由于山西矿难和山西政策性治理整顿30万吨以下小型煤矿，更助推了无烟煤价格的坚挺不下。即使在2008年下半年煤炭价格下跌、市场疲软的情况下，山西无烟煤购进价格仍居高不下。平顶山某化肥生产企业反映，该企业从山西购进的无烟煤，从2008年1月份起至10月份呈逐月上涨态势，由1月份的746.01元/吨飙升至10月份的1105.81元/吨。
（二）化肥生产企业用电用气优惠力度不够。据化肥企业负责人反映，国家对于化肥企业用电用气有一定的优惠政策，但是力度不够，效果一般。如对于企业用电，虽然国家和当地政府给予企业一定的优惠，但是在用电的高谷峰时期，优惠政策落实有差别。高峰时期优惠较少，谷底时期优惠较多，实际上企业的用电成本并没有降低。
（三）化肥企业融资困难。据企业反映，银行处于自身利益考虑，企业不缺资金时，银行主动上门“锦上添花”，企业急需资金时，银行并没有“雪中送炭”，致使企业常常因为资金困难不能正常生产。
（四）外运火车皮紧张。据调查，部分化肥生产企业产品外运所需车皮紧张。一是计划审批难，需要多方多次协调才能解决，影响企业正常生产；二是货运管理不规范，装载货物时不按车皮标定重量装载，收费却按车皮标重收费。如标重为60吨的车皮只允许装载50吨的货物，收费则按60吨车皮标重收取，企业为了及时出货，只能听之任之，增加了企业的销售成本。据有些企业反映，目前外运车皮并不是非常紧张，只有外运农资产品的车皮稍有紧张，原因是农资货物运费低，铁路方面不愿意多发车皮运输，导致了有的化肥生产企业不能按时发货，影响了企业正常的生产经营、销售和企业的信誉。
（五）化肥市场鱼目混珠。一是化肥生产企业准入门槛太低。近几年，化肥生产企业中涌现了许多企业规模小、技术水平低、生产能力弱、资金短缺的小型复合肥生产企业。这些企业的整体竞争能力较差，在市场竞争中处于弱势；二是化肥市场假冒伪劣产品泛滥。这些产品大部分外包装标示和内装量不一致，标准含量低、质量差，因其价格低廉受到农民的青睐。据了解，复合肥中某种元素含量减少一个点，随之就可降低成本70至80元，若氮、磷、钾都减少一个点，一吨化肥就可降低成本240元。这些产品的存在对那些标准高、含量高、成本高的大型化肥生产企业销售市场构成了很大冲击。
