阿维菌素这种生物农药在我国市场上已经发展了十多年，由于其高效、低毒、高选择性的特点，至今已成为人们普遍接受的主流农药，并被农业部推荐为无公害农药。
中投顾问化工行业研究员常轶智人为，虽然阿维菌素产品备受市场欢迎，但同时也面临着一些挑战。主要表现在害虫的抗性增强、环境污染严重以及生产成本偏高等方面。
首先，随着阿维菌素的不断普及，使用规模逐渐扩大，但是，由于使用方法不科学，使得害虫对阿维菌素的抗药性渐渐显露。据相关消息显示，目前，在长江以南的地区，阿维菌素使用的效果已经大打折扣，害虫对其抗性非常强，而在北方地区，害虫也已经表现出了抗性增强的现象。在将来，使用阿维菌素产品的可持续性受到威胁。
以蔬菜小菜蛾为例，蔬菜小菜蛾对阿维菌素的抗药性随着选育代数的增加而增加，经 27代后抗性可高达812.7倍。而全国各地区植保站的监测也表明，各地小菜蛾对阿维菌素的敏感性已经逐步下降，甚至达到了中抗水平。
其次，阿维菌素在生产过程中产生的污水和废渣不能得到较好的处理，使得环境污染严重，不符合低碳经济发展的要求。因此，阿维菌素产业的发展面临环境保护的问题。
此外，阿维菌素是一个高耗能的产业，据相关数据显示，其能耗占到总生产成本的30%以上，生产成本比较高，而且菌株的选择比较困难，也使得阿维菌素的发展受到了限制。
因此，为应对这些问题，我国阿维菌素的相关企业和部门需要加大对阿维菌素使用技术的推广以及增加环保设施的投入，同时，也要逐步完善生产技术，降低成本压力。
在国内市场，1995年1.8%的阿维菌素制剂防治无抗性害虫稀释倍数在15000倍，现在1.8%阿维菌素制剂防治害虫的稀释倍数在2000～3000倍。
