提高农作物品质，改善农产品质量
我国农产品质量整体水平不高，主要原因是农民施肥不当，特别是过量偏施氮素化肥导致蔬菜硝酸盐含量过高，水果变酸、皮厚、色淡，稻米、植物油的一些质量指标降低。通过测土配方施肥，合理地使用肥料，基本可以使农产品质量达到或超过无公害农产品标准。
降低农业生产资料投入，控制农产品生产环境质量
在我国，氮肥的当季利用率为30%-50%，磷肥为10%-20%，钾肥为50%左右。通过测土配方施肥，可以减少不合理施肥造成的损失，提高肥料的利用率，降低农业生产资料投入，增加农作物的收成，控制农产品生产环境质量。
保护农业生态环境，保证农业可持续发展
施用的化学氮肥，如果不能被作物吸收，则会经过一系列的转化，被淋洗到土壤深层，发生还原，生成致癌作用很强的亚胺类化合物。磷肥中大都含重金属以及放射性元素，危害着人类的健康。而且有资料显示：农田氮、磷是水体富营养化的主要营养源。通过测土施肥，可使施入土壤中的化学肥料尽可能地被作物吸收利用，这样滞留在土壤中的肥料就会很少，有益于保护农业生态环境。
